Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSSP25774 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSSP25774 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSSP25774 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSSP25774 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSSP25774 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSSP25774 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSSP25774 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSSP25774 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSSP25774 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms