Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1P21675 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1P21675 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1P21675 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1P21675 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1P21675 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1P21675 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms