Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AMY2BP19961 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms