Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EGR1P18146 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EGR1P18146 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EGR1P18146 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms