Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DSPP15924 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSPP15924 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSPP15924 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSPP15924 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms