Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
IFITM1P13164 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms