Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGAMP11215 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGAMP11215 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms