Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLUP10909 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLUP10909 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLUP10909 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLUP10909 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLUP10909 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLUP10909 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms