Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD2P0DJD1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD2P0DJD1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms