Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ITGA5P08648 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms