Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TYMSP04818 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TYMSP04818 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms