Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDX58O95786 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDX58O95786 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
DDX58O95786 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDX58O95786 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms