Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC28A2O43868 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms