Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM6AO15550 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM6AO15550 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms