Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MUSKO15146 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MUSKO15146 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms