Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EBAG9O00559 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EBAG9O00559 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms