Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVH48-1M5A8F1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVH48-1M5A8F1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms