Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HHLA1C9JL84 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms