Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SRRM5B3KS81 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms