Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NEURL1BA8MQ27 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NEURL1BA8MQ27 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms