Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRT87PA6NCN2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms