Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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