Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAI2Q9Y5P3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms