Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms