Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMED5Q9Y3A6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms