Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMFRQ9UKV5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms