Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP21Q9UK80 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms