Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNNA3Q9UI47 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms