Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUF60Q9UHX1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUF60Q9UHX1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms