Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHRNA9Q9UGM1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHRNA9Q9UGM1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms