Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHPF2Q9P2E5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms