Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD1BQ9P298 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms