Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA2D2Q9NY47 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA2D2Q9NY47 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms