Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM248Q9NWD8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM248Q9NWD8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms