Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFT57Q9NWB7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms