Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA3GQ9NS98 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms