Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCUBE2Q9NQ36 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms