Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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