Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HIGD2AQ9BW72 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms