Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
THUMPD2Q9BTF0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THUMPD2Q9BTF0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms