Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3CQ99985 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms