Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCNX1Q96RV3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCNX1Q96RV3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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