Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CITED4Q96RK1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms