Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SORCS2Q96PQ0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SORCS2Q96PQ0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms