Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC74BQ96LY2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC74BQ96LY2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms