Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLMNQ96JQ2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLMNQ96JQ2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms