Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRIG1Q96JA1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIG1Q96JA1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms