Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NMD3Q96D46 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms