Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAVIN3Q969G5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms