Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C17orf47Q8NEP4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C17orf47Q8NEP4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms